L’Institut Pasteur d’Algérie (IPA) abrite du 13 au 17 août courant, un atelier de formation au profit de 11 pays africains sur le séquençage génomique des virus grippaux et du sars-CoV-2.

Organisée en coordination avec l’Organisation Mondiale de la Santé (OMS) et animée par des experts américains, cette session de formation vise à renforcer les capacités des pays participants, à savoir, l’Algérie, le Burkina Faso, la Côte d’Ivoire, Madagascar, le Mali, la Mauritanie, le Niger, la République Démocratique du Congo, la République Centrafricaine, le Sénégal et le Togo, dans le domaine du séquençage génétique des virus grippaux et du sars-CoV-2. Et ce, notamment, en ce qui concerne les méthodologies et les méthodes expérimentales de séquençage de nouvelle génération en vue du séquençage rapide d’échantillons respiratoires positifs.

Les participants bénéficieront également d’une formation sur les principes bio-informatiques de l’analyse des données de séquençage à partir d’échantillons cliniques: contrôle de qualité des données, alignement et assemblage des séquences, analyses phylogénétiques et soumission des séquences.

Renforcer les capacités de surveillance : un objectif majeur

Selon les organisateurs, les objectifs de cette formation sont :

• Former les participants aux méthodes expérimentales de séquençage de nouvelle génération en vue du séquençage rapide d’échantillons respiratoires s’étant révélés positifs pour un virus de la grippe ou du SARS-COV-2 ;
• Former les participants aux principes bio informatiques de l’analyse des données de séquençage à partir d’échantillons cliniques : contrôle de qualité des données, alignement et assemblage des séquences, analyses phylogénétiques et soumission des séquences dans la base de données publique GISAID ;
• Renforcer les capacités de surveillance nationale et régionale des agents pathogènes respiratoires à travers les laboratoires du système mondial de surveillance de la grippe et de riposte (GISRS), en améliorant le séquençage génomique, l’analyse bio-informatique et le partage des données.

C.B.